热带生物组学大数据计算及应用团队-陆俊锟
团队名称:热带生物组学大数据计算及应用团队
所属协同创新中心:生态文明协同创新中心
团队负责人:
陆俊锟,博士,研究员,2011年在中国林科院获森林培育专业博士学位。2017年国家自然科学基金优秀青年基金获得者,2019年入选全国林草科技创新领军人才,2022年入选中国林科院青年领军人才支持计划。
陆俊锟研究员长期从事树木生理研究。在应用基础研究方面,针对寄生植物檀香与寄主植物间的生理生态特性,发现檀香兼具自养与异养的混合养分摄取机制;揭示根系分泌物识别是檀香寄主偏好性的关键步骤,证实了海南黄花梨通过分泌黄酮、酚类物质来诱导檀香吸器趋向性生长,使两树种间建立更多的养分传输通道,从而促进檀香的生长与养分积累;发现檀香与海南黄花梨间存在着明显的氮素双向传递,并提出和证明了海南黄花梨接种高效固氮根瘤菌后,两树种间的氮素传递率显著提高的创新观点。上述研究得到国内外同行的高度评价,产生了较大的国际影响力。近10年来,陆俊锟团队先后主持省部级课题10项,包括国家自然科学基金5项、青年科学家项目1项等。以第一或通讯作者发表SCI论文15篇。已授权专利2件。
团队研究方向:
1. 檀香-黄花梨寄生理化性质和分子基础的研究;
1. 开发基因组、转录组、蛋白组、表型组等大数据分析软件和算法优化,以及数据库构建;
2. 基于生物组学数据研究热带林木花卉优异性状形成的遗传基础。
团队成员:
1. 谢尚潜,教授;
2. 唐敏强,副教授
团队代表性成果:
代表性论文:
(1) Mixture enhances microbial network complexity of soil carbon, nitrogen and phosphorus cycling in Eucalyptus plantations[J]. Forest Ecology and Management, 2024, 553: 121632. (陆俊锟唯一通讯作者);
(2) Nitrogen rather than carbon released by litter decomposition mediates nutrient relationships in a multispecies forest plantation with hemiparasite [J]. Science of the Total Environment, 2023, 888: 164176. (陆俊锟唯一通讯作者);
(3) Host root exudates initiate a foraging preference by the root parasite Santalum album [J]. Tree Physiology, 2022, 43: 301-314. (陆俊锟唯一通讯作者,他引2次);
(4) Melatonin enhances nitrogen metabolism and haustorium development in hemiparasite Santalum album Linn. Environmental and Experimental Botany, 2021, 186: 104460. (陆俊锟唯一通讯作者,他引8次);
(5) Impacts of nitrogen on physiological interactions of the hemiparasitic Santalum album and its N2-fixing host Dalbergia odorifera. Trees-Structure and Function, 2021, 35: 1039–1051. (陆俊锟唯一通讯作者,他引5次);
(6) SCSit: A high-efficiency preprocessing tool for single-cell sequencing data from SPLiT-seq.Computational and Structural Biotechnology Journal, 2021.(谢尚潜通讯作者,他引3次);
(7) DNA N6-Methyladenosine modification role in transmitted variations from genomic DNA to RNA in Herrania umbratica. BMC genomics, 2019, 20:508.(谢尚潜通讯作者,他引4次);
(8) MDR: an integrative DNA N6-methyladenine and N4-methylcytosine modification database for Rosaceae. Horticulture Research, 2019, 6: 78.(谢尚潜通讯作者,他引58次);
(9) Genome-wide characterization of R2R3-MYB gene family in Santalum album and their expression analysis under cold stress. Frontiers in Plant Science, 2023,14:1142562.(唐敏强第一作者,谢尚潜通讯作者,他引3次);
(10) Arabidopsis GDSL1 overexpression enhances rapeseed Sclerotinia sclerotiorum resistance and the functional identification of its homolog in Brassica napus. Plant Biotechnology Journal, 2020,18,1255-1270;(唐敏强第一作者,他引33次).
代表性专利:
1、谢尚潜,肖传乐,谢志.基于多组学丰度信息的蛋白质二级质谱鉴定方法,201610737420.7;
2、谢尚潜,刘宇枭,林加论,邢剑锋.一种单细胞测序的数据分类方法,201811501781.7;
3. 唐敏强, 胡旭, 王志勇, 廖丽, 郝江珊, 许涛, 潘佳慧. 一种海雀稗耐镉性状的SNP分子标记及其应用,2023, ZL202110974836.1;
代表性著作:
1. Gill Ali, Md Mostofa Uddin Helal, Minqiang Tang, Ming Hu, Chaobo Tong, Shengyi Liu: High-Throughput Association Mapping in Brassica napus L.: Methods and Applications. Springer,2022.
获奖及荣誉称号:
1)中国林学会第七届梁希青年论文二等奖,2018;
2)全国林草科技创新人才计划科技创新领军人才,2019;
3)森林中的吸血鬼——广寄生, 全国优秀林草科普微视频, 2023。
团队合影: