个人简介

  美国加州大学戴维斯分校访问学者，海南省南海青年名家，中国民族医药协会黎医药分会理事，热区石漠化山地绿色高效农业科技新联盟理事，海南大学热带作物学院副院长，中国热带农业科学院热带生物组学大数据中心副主任。中央民族大学联合培养研究生导师，中国农业大学联合培养博士研究生导师，青海大学联合培养博士研究生导师。近10年来一直从事基因组，重测序，转录组和高通量技术开发等研究，在生物信息学，分子育种技术方法领域广泛涉猎和较丰富的研究经验。建立了高通量多组学图谱和高性能生物信息技术为基础的技术平台。在热带生物组学大数据中心，执行开发了多维度组学创新平台，提供一个全新的在染色体层面上的基因组、甲基化、转录组的大数据分析体系。不断开发新的实验技术和大数据算法。原创研发两代超低成本基因型分型技术和表观遗传分析技术，现已成功用于约20个物种研究中，已申报国家发明专利四项，荣获国家发明专利授权一项。在Nucleic  Acids Research、Biotechnol Biofuels、Molecular Ecology  Resources、Nature、Nature  Communications等SCI杂志发表具有影响力的学术论文，累积影响因子约200，其中第一作者或通讯作者22篇，累积影响因子约100。担任2项国家重点研发项目专题负责人，主持和参加国家自然科学基金、重点基金、科技部973项目、国家木薯产业体系等科研项目10余项。

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一、基本信息

姓名: 夏志强  

性别: 男

民族: 汉

出生年月: 1982年10月

学位: 博士

职称: 研究员

开设课程：基因组学（研究生），生物信息学（研究生），南繁育种（本科）

主要研究方向：基因组与大数据育种

博士研究生招生方向：作物遗传育种

硕士研究生招生方向：作物学\农艺与种业\资源利用与植物保护

二、联系方式

E-mail: zqiangx@gmail.com

三、教育经历

2016.01-2017.11 美国 加州大学戴维斯分校UCDavis 访问学者/生物信息学

2012.09-2018.12 中国 华中农业大学 作物遗传育种 博士

2005.09-2008.06 中国 海南大学 作物遗传育种 硕士

2001.09-2005.06 中国 华南热带农业大学 生物技术 学士

四、科研与学术工作经历

2020.07-至今   中国 海南大学 副研究员

2018.01-2020.07 中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 副研究员

2013.01-2017.12  中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 助理研究员

2008.12-2012.12  中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 研究实习员

五、代表性科研项目

1. 国家重点研发计划项目，2019YFD1000500，热带作物种质资源精准评价与基因发掘，2019.01-2022.12，120万，在研，专题负责人

2. 国家重点研发计划项目，2019YFD1001100，热带作物高效育种技术与品种创制，2019.01-2022.12，200万，在研，专题负责人

3. 滇桂黔石漠化地区特色作物产业发展关键技术集成示范项目，SMH2019-2021，石漠化地区特色作物指纹图谱开发，2019.01-2022.12，60万，在研，主持

4. 国家自然科学基金青年基金项目，31301102，基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性（AFSM），2014.01-2016.12，23万元，已结题，主持

六、编审

2017年7月-至今 Acta Physiologiae Plantarum国际学术期刊（SCI）

2018年12月-至今 Plos One国际学术期刊（SCI）

2018年2月-至今 Plant Physiology and Biochemistry 国际学术期刊（SCI）

2018年1月-至今 Frontiers of Agricultural Science and Engineering国际学术期刊（SCI）

2019年6月-至今 Industrial Crops and Products国际学术期刊（SCI 一区）

2019年12月-至今 Biotechnol Biofuels 国际学术期刊（SCI 一区）

2020年1月-至今 Horticulture Research国际学术期刊（SCI一区）

七、代表性成果

      （一）授权专利

       1) 测序引物组及基于PCR的全基因组测序方法 201910261027.9

       2) 基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性（AFSM）201410154134.9

       3) 一种胞嘧啶甲基化挖掘的方法 201611198974.0

       4) 一种全基因组高效基因区富集测序方法201611199575.6

       5) Whole Genome High-Efficiency Gene Region Enriching and Sequencing Method 2021105278 2021.8 1 国际专利

       6) A Simple, Cost-effective and Amplification-based Whole Genome Sequencing  Approach 2020/06979 2021.6 1 国际专利

      （二）获得奖励

       1) 2015年海南省科技进步一等奖：木薯比较基因组及光合产物高效积累机理 2015-J-1-R-048

2) 2016-2017年度神农中华农业科技奖二等奖：木薯全基因组测序及育种基础 KJ2017-R2-012-03

3) 2016年世界块根块茎作物大会（World Congress On Root And Tuber Crops）大会Poster一等奖

（三）学术论文

1)  Zhiqiang Xia, Dongmei Huang, Shengkui Zhang, Wenquan Wang, Funing Ma,  Bin Wu, Yi Xu, Bingqiang Xu, Di Chen, Meiling Zou, Huanyu Xu, Xincheng  Zhou, Rulin Zhan, Shun Song. Chromosome-Scale Genome Assembly Provides  Insights into the Evolution and Flavor Synthesis of Passion Fruit  (Passiflora edulis Sims) 2020（Horticulture Research, IF：6.793，一区，第一作者）

2)  Shengkui Zhang(#), Zhiqiang Xia(#), Wenqing Zhang, Can Li, Xiaohan  Wang, Xianqin Lu, Xianyan Zhao, Haizhen Ma, Xincheng Zhou, Weixiong  Zhang, Tingting Zhu, Pandao Liu, Guodao Liu, Hubiao Yang, Jacobo Arango,  Michael Peters, Wenquan Wang, Tao Xia Chromosome-Scale Genome Assembly  Provides Insights into Speciation of Allotetraploid and Massive Biomass  Accumulation of Elephant Grass (Pennisetum purpureum Schum.) Molecular  Ecology Resources 2022,1（（SCI收录，IF：7.090，第一作者）

3)  Kaixing Fang, Zhiqiang Xia, Hongjian Li, Xiaohui Jiang, Dandan Qin,  Qiushuang Wang, Qing Wang, Chendong Pan, Bo Li and Hualing Wu,  Genome-wide Association Analysis Identifies Molecular Markers Asociated  with Tea Flavor-related Metabolites 2021（Horticulture Research,  IF：6.793，一区，第一作者）

4)  Xia Z, Zou M, Zhang S, Feng B, Wang W. AFSM sequencing approach: a  simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site  discovery and genetic mapping. Scientific Reports, 2014, 4: 7300.  （SCI收录，IF：5.578，第一作者）

5)  Gu J#, Xia Z#, Luo Y, Jiang X, Qian B, Xie H, Zhu J, Xiong L, Zhu J,  Wang Z. Spliceosomal protein U1A is involved in alternative splicing and  salt stress tolerance in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Res, 2018,  46(4):1777-1792.（SCI收录，IF：11.561，第一作者）

6)  Xia Z, Zhang S, Wen M, Lu C, Sun Y, Zou M, Wang W. Construction of an  ultrahigh-density genetic linkage map for Jatropha curcas L. and  identification of QTL for fruit yield. Biotechnol Biofuels, 2018,  11:3（SCI收录，IF：5.497，第一作者）

7)  Xia Z, Liu K, Zhang S, Yu W, Zou M, He L, Wang W. An ultra-high density  map allowed for mapping QTL and candidate genes controlling dry latex  yield in rubber tree. Industrial Crops and Products, 2018, 120:351-356.  （SCI收录，IF：3.849，第一作者）

8)  Wang W#, Feng B#, Xiao J#, Xia Z, Zhao X, Li P, Zhang W, Wang Y, Moller  B, Liu B, Li K, Peng M. Cassava genome from a wild ancestor to  cultivated varieties. Nature Communications 2014,  5:5110（SCI收录，IF：11.470，第二作者）

9)  Hu W#, Xia Z#, Yan Y, Ding Z, Tie W, Wang L, Zou M, Wei Y, Lu C, Hou X,  Wang W, Peng M. Genome-wide gene phylogeny of CIPK family in cassava  and expression analysis of partial drought-induced genes. Frontiers in  plant science 2015, 6: 914.（SCI收录，IF：4.495，第一作者）

10)  Wei Y#, Shi H#, Xia Z#, Tie W, Ding Z, Yan Y, Wang W, Hu W, Li K.  Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the WRKY Gene  Family in Cassava. Frontiers in plant science 2016, 7,  25:1-18（SCI收录，IF：4.291，第一作者）

11)  Zou M, Lu C, Zhang S, Chen Q, Sun X, Ma P, Xia Z*, Wang W*. Epigenetic  map and genetic map basis of complex traits in cassava population.  Scientific Reports. 2017, 7: 41232. （SCI收录，IF：4.259，通讯作者）

12)  Shengkui Zhang(#), Zhiqiang Xia(#), Wenqing Zhang, Can Li, Xiaohan  Wang, Xianqin Lu, Xianyan Zhao, Haizhen Ma, Xincheng Zhou, Weixiong  Zhang, Tingting Zhu, Pandao Liu, Guodao Liu, Hubiao Yang, Jacobo Arango,  Michael Peters, Wenquan Wang, Tao Xia Chromosome-Scale Genome Assembly  Provides Insights into Speciation of Allotetraploid and Massive Biomass  Accumulation of Elephant Grass (Pennisetum purpureum Schum.)  bioRxiv,2020 doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.28.970749 （第一作者）

13)  Congshan Xu 1,†, Zhiqiang Xia 2,†, Zhiqiang Huang 3, Chao Xia 4, Jing  Huang 1, Manrong Zha 5, Shujuan Wang 1, Muhammad Imran 1,6, Shaun  Casteel 1,  Yiwei Jiang 1, Cankui Zhang 1,7,*Understanding the  Physiological and Transcriptional Mechanism of Reproductive Stage  Soybean in Response to Heat Stress 2020 Crop Breed Genet Genom  2020;2(1):e200004.

14)  Luo M, Gu Y, Puiu D, Wang H, Twardziok S, Deal K, Huo N, Zhu T, Wang L,  Wang Y, McGuire P, Liu S, Long H, Ramasamy R, Rodriguez J, Van S, Yuan  L, Wang Z, Xia Z, Xia L, Anderson O, Ouyang S, Liang Y, Zimin A, Pertea  G, Salzberg S, Devos K, Dvorak J. Genome sequence of the progenitor of  the wheat D genome Aegilops tauschii. Nature, 2017, 551:7681.  （SCI收录，IF：41.577）

15)  Liu J#, Xia Z#, Tian X#, Li Y. Transcriptome sequencing and analysis of  rubber tree (Hevea brasiliensis Muell.) to discover putative genes  associated with tapping panel dryness (TPD). BMC Genomics 2015,16:398.  （SCI收录，IF：3.867，第一作者）

16)  Hao C#, Xia Z#, Fan R, Tan L, Hu L, Wu B, Wu H. De novo transcriptome  sequencing of black pepper (Piper nigrum L.) and an analysis of genes  involved in phenylpropanoid metabolism in response to Phytophthora  capsici. BMC Genomics 2016, 17: 822. （SCI收录，IF：3.729, 第一作者）

17)  Zhang S, Chen X, Lu C, Ye J, Zou M, Lu K, Feng S, Pei J, Liu C, Zhou X,  Ma P, Li Z, Liu C, Liao Q, Xia Z*, Wang W*. Genome-Wide Association  Studies of 11 Agronomic Traits in Cassava (Manihot esculenta Crantz).  Frontiers in Plant Science, 2018, 9:503. （SCI收录，IF：3.678，通讯作者）

18)  Hu W#, Wei Y#, Xia Z#, Yan Y, Hou X, Zou M, Lu C, Wang W, Peng M.  Genome-wide identification and expression analysis of the NAC  transcription factor family in cassava. PloS one 2015, 10(8):  e0136993.（SCI收录，IF：3.057，第一作者）

19)  Hu W#, Hou X#, Xia Z#, Yan Y, Wei Y, Wang L, Zou M, Lu C, Wang W, Peng  M. Genome-wide survey and expression analysis of the calcium-dependent  protein kinase gene family in cassava. Molecular Genetics and Genomics  2016, 291(1):241-253.（SCI收录，IF：2.979，第一作者）

20)  Zou M#, Xia Z#, Ling P, Zhang Y, Chen X, Wei Z, Bo W, Wang W. Mining  EST-Derived SSR Markers to Assess Genetic Diversity in Cassava (Manihot  esculenta Crantz). Plant Mol Biol Rep, 2011, 29:961-971 (SCI，IF：2.153,  第一作者)

21)  Tang Y#, Xia Z#, Ding Z#, Ding Y, Liu Z, Ma X, Liu J. Construction of a  high-density linkage map and QTL mapping for important agronomic traits  in Stylosanthes guianensis (Aubl.) Sw. Scientific Reports, 2019,  9:3834.（影响因子：4.36，第一作者）

22)  Zou M#, Xia Z#, Lu C, Wang H, Ji J, Wang W. Genetic Diversity and  Differentiation of Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg Revealed by ISSR and  SRAP Markers. CROP SCIENCE, 2012, 52(5):2304-2313 (SCI，IF：1.513, 第一作者)

23)  Chen X#, Xia Z#, Fu Y, Lu C, Wang W. Constructing a genetic linkage map  using an F-1 population of non-inbred parents in Cassava (Manihot  esculenta Crantz). Plant Mol Biol Reporter 2010, 28:676-683  (SCI，IF：0.825, 第一作者)

24)  Yang C#, Xia Z#, Hu J, Zhuang Y, Pan Y, Liu J. Transcriptome analysis  of Oncidium petals provides new insights into the initiation of petal  senescence. Journal of Horticultural Science and Biotechnology, 2018,  94(1):1-12.（影响因子：0.715，第一作者）

25)  Chen X, Xia J, Xia Z, Zhang H, Zeng C, Lu C, Zhang W, Wang W. Potential  functions of microRNAs in starch metabolism and development revealed by  miRNA transcriptome profiling of cassava cultivars and their wild  progenitor. BMC Plant Biology 2015, 15:33（SCI，IF：3.930）

26)  Ye J, Yang H, Shi H, Wei Y, Tie W, Ding Z, Yan Y, Luo Y, Xia Z, Wang W,  Peng M, Li K, Zhang H, Hu W. The MAPKKK gene family in cassava:  Genome-wide identification and expression analysis against drought  stress. Scientific reports 2017, 7: 14939.（影响因子：4.259）

27)  Ma P#, Chen X#, Liu C, Xia Z, Song Y, Zeng C, Li Y, Wang W. MePHD1 as a  PHD-Finger protein negatively regulates ADP-Glucose pyrophosphorylase  small subunit1a gene in cassava. International Journal of Molecular  Sciences 2018, 19: 2831.

28)  Shang S#, Wu C#, Huang C#, Tie W, Yan Y, Ding Z, Xia Z, Wang W, Peng M,  Tian L, Hu W. Genome-Wide Analysis of the GRF Family Reveals Their  Involvement in Abiotic Stress Response in Cassava. Genes 2018, 9:  110.（影响因子：3.49）

29)  Hu W, Yan Y, Tie W, Ding Z, Wu C, Ding X, Wang W, Xia Z, Guo J, Peng M.  Genome-Wide Analyses of Calcium Sensors Reveal Their Involvement in  Drought Stress Response and Storage Roots Deterioration after Harvest in  Cassava. Genes, 2018, 9: 221.（影响因子：3.49）

30)  Ou W#, Mao X#, Huang C#, Tie W, Yan Y, Ding Z, Wu C, Xia Z, Wang W,  Zhou S, Li K, Hu W. Genome-Wide Identification and Expression Analysis  of the KUP Family under Abiotic Stress in Cassava (Manihot esculenta  Crantz). Frontiers in Physiology. 2018; 9: 17.（影响因子：3.66）

31)  Hu M, Hu W, Xia Z, Zhou X, Wang W. Validation of Reference Genes for  Relative Quantitative Gene Expression Studies in Cassava (Manihot  esculenta Crantz) by Using Quantitative Real-Time PCR. Frontiers in  plant science 2016, 7:680（SCI，IF：3.678）

32)  Ma P#, Chen X#, Liu C, Meng Y, Xia Z, Zeng C, Lu C, Wang W. MeSAUR1,  encoded by a small auxin-up RNA gene, acts as a transcription regulator  to positively regulate ADP-glucose pyrophosphorylase small subunit1a  gene in cassava. Frontiers in Plant Science 2017, 8:1315.

33)  Xu C#, Xia C#, Xia Z, Zhou X, Huang J, Huang Z, Liu Y, Jiang Y, Casteel  S, Zhang C. Physiological and transcriptomic responses of reproductive  stage soybean to drought stress. Plant Cell Reports 2018, 37:1611-1624.

34)  Pei J, Wang H, Xia Z, Liu C, Chen X, Ma P, Lu C, Wang W. Phylogeny and  expression pattern of starch branching enzyme family genes in cassava  (Manihot esculenta Crantz) under diverse environments.  Molecular and  Cellular Biochemistry 2015, 406 (1): 273-284（SCI，IF：2.561）